奥美拉唑是全世界第一个发售的质子泵缓聚剂类药，归属于第一代质子泵缓聚剂。可以合理的抑止胃粘膜壁质子泵，持续抑制胃酸的代谢。
拉唑类药物一般耐受力优良，副作用较少。但长期服用奥美拉唑，也可能会产生一些副作用。
最关键的副作用有：
恶心想吐、腹胀、腹泻、便秘，上腹部疼痛等。皮肤副作用可能出現皮疹，也少许转氨酶及但血红蛋白上升的状况出現，一般全是轻度的，断药能够恢复过来，一般不影响医治。
服食奥美拉唑中枢神经系统可能造成的副作用有头昏、头痛、总想睡觉、失眠及颈静脉神经炎等。
比较严重肾功能不全者和婴儿禁止使用该药品。
除开所述副作用，服食奥美拉唑还需要留意药品的相互影响，奥美拉唑关键经肝脏新陈代谢，可以缓解经肝脏新陈代谢药品的身体清除。
在服食奥美拉唑时，假如同屏地西泮、苯妥英钠，华法林，硝苯地平等药品时，应降低这种药品的使用量，以避免奥美拉唑造成的药品过多产生。
奥美拉唑是一种偏碱药品，因而一般制成肠溶中药制剂，从肠胃中的弱碱性自然环境中才可以充分发挥较大 功效，因而针对奥美拉唑，要整颗药品吞食，不可以扒开或嚼碎服食。
尽管奥美拉唑制酸好用，不良反应也不大，但不适合长期服用奥美拉唑抑制胃酸代谢，减轻肠胃不适。
尽管这不是奥美拉唑的副作用，但有研究发现，长期服用奥美拉唑抑制胃酸代谢，可能会造成萎缩性胃炎。
因而，如非医治需要，不建议长期服食奥美拉唑。