生物威胁的来源有战争带来的生物威胁，自然灾害引发的生物威胁，突发事件引发的生物威胁。通常人们把战争、自然灾害和突发事件等因素导致病源微生物大量地、突发地繁殖、给人类社会和健康带来集中的伤害，称为生物威胁。
战争：是一种集体、集团、组织、派别、国家、政府互相使用暴力、攻击、杀戮等行为，为满足一定的政治、经济、领土等目的，而武装战斗。
自然灾害：是损害人类生活环境的自然现象，包括干旱、高温、低温、寒潮、洪涝、山洪、台风、龙卷风、暴雨、暴雪、冻雨、大雾、大风、滑坡、雷电、火山喷发等。
突发事件：突然发生造成严重社会危害，要采取应急处置措施予来应对各个事件。
病源微生物是可以侵害身体，造成影响乃至传染病的微生物，或称病原体。病原体中以病菌的危害最高，病源微生物包含朊毒体、细菌、病菌、球菌、衣原体、立克次体、支原体、病毒感染等。