长期吃乳果糖的危害是可能会引起胃肠道不适，另外还有可能会影响到个人的身体健康，因此在服用药物的时候也需要按疗程服用，尽量避免服用过多。
乳果糖属于一种有机物，通常多应用于保健品以及食品添加剂中，并且能够调节肠道微生态，还有助于抑制肠道内毒素的吸收，也能够起到润肠通便的作用，对于肠道菌群紊乱所引起的便秘以及腹泻能够起到改善的作用，但是任何的药物都有一定的副作用，如果长期服用很有可能会导致消化道出现不适的症状，比如胃胀痛还有可能会伴有厌食遗精恶心的症状，另外也有可能会引起腹泻，在服用的时候还需要听懂医生的嘱咐，尽量避免长期大剂量的服用，以免影响到身体健康。
平时还要改善不良的饮食结构，可以适当吃些蔬菜以及水果，也可以在饭后到户外散步，通常能够促进肠胃蠕动，还可以促进食物的消化和吸收，从而可以改善消化不良的问题，并且还有助于预防便秘以及改善便秘。日常还要养成早睡早起的良好习惯，还可适当喝些温热的白开水，能够促进身体新陈代谢。