木薯淀粉和马铃薯淀粉通常来说不一样，这属于两种完全不同食品，提取的方式以及质地是不相同。
马铃薯淀粉主要是把马铃薯煮熟之后，然后还需要晾干，然后经过精细磨碎之后所得到的，而木薯淀粉是木薯经过淀粉提取后脱水干燥而制成的一种粉末，马铃薯淀粉和木薯淀粉质地也是不一样的，马铃薯淀粉的粘性相对来说会比较多，而且质地比较细腻，颜色一般会呈现洁白色，看起来显得会比较干净，同时还具有一股马铃薯的味道，而木薯淀粉的颜色一般会呈现白色无异味，大多数在经过蒸煮之后，会形成浆糊以及清澈透明的形态，一般适用于色素调色。
木薯淀粉和马铃薯淀粉都是可以使用的，里面不含有任何的有害物质，在使用之后并不会给人体的健康带来伤害，但是是无论木薯淀粉还是马铃薯淀粉都比较不容易消化，在使用的时候需要掌握好量，尽量不要使用过度隐秘导致肠胃道负担加重，从而且会导致患者出现消化不良，而且还会出现恶心和呕吐，对于其他食物摄入也会造成一定影响。